Curso 93-94: Bachilleratos experimentales de ciencias humanas y sociales, y ciencias de la naturaleza.
Curso 94-95: Módulo profesional de nivel II "Auxiliar de administración y gestión".
Curso 95-96: Ciclo formativo de FP específica "Gestión administrativa" y Programas de garantía social.
Curso 96-97: Primer ciclo de la ESO y Ciclo formativo de FP específica "Equipos e instalaciones electrotécnicas".
Curso 97-98: Se actualiza la denominación del centro como "Instituto de Educación Secundaria Doctor Francisco Marín" (Decreto 200/97 de 3 de septiembre. BOJA 104 de 06.09.97).
Curso 98-99: Ciclo formativo de FP específica "Técnico en cocina".
Curso 00-01: Educación secundaria de adultos (2º ciclo).
Curso 02-03: Ciclo formativo de FP específica "Cuidados auxiliares de enfermería".
Curso 07-08: Inclusión del centro en los proyectos educativos "Centros TIC" y "El deporte en la escuela".
Curso 08-09: Comienza a impartirse el nuevo Programa de cualificación profesional (antiguo PGS): "Auxiliar de mantenimiento de vehículos".
Curso 09-10: Se comienza a impartir el segundo curso del PCPI.
Curso 10-11: Se modifica el tipo de enseñanza en adultos, pasando de la enseñanza presencial a la semipresencial.
Curso 11-12: Centro bilingüe en inglés.